Future Clinic (Preparación del escenario de la medicina genómica personalizada)

Project Description

La reciente aparición y popularización de nuevas metodologías como la secuenciación de nueva generación (NGS de sus siglas inglesas Next Generation Sequencing), ha cambiado completamente el panorama en el que se va a desarrollar la clínica en la próxima década. La NGS se ha empezado a aplicar con un gran éxito en el descubrimiento de genes de enfermedades hereditarias y en cáncer y es la herramienta que permitirá hacer realidad definitivamente las promesas de la medicina personalizada.

El proyecto FUTURE CLINIC constituye la primera iniciativa que se promueve desde un sistema de salud público que dispondrá de las herramientas para llevar a cabo la implantación de la medicina personalizada.

La medicina personalizada supondrá un ahorro en el gasto sanitario, a la vez que se mejorará la calidad asistencial al paciente. El uso de información genómica permitirá la aplicación de una medicina de carácter más personalizado, que significa dar la medicina correcta al paciente adecuado en la dosis apropiada. Para la consecución de dicho objetivo general, se plantean los siguientes objetivos específicos: Investigación en algoritmia y sistemas de procesamiento de la información genómica. Investigación en tecnologías y sistemas necesarios para la integración de dicha información con los sistemas sanitarios actuales. Investigación en tecnologías y soluciones de ayuda al diagnóstico que permitan incorporar dicha información genómica en el análisis clínico.

Indra's Role

Líder del proyecto.

Universities and Technological Centres

Technologies used

Las actividades se centrarán en el análisis de los algoritmos utilizados actualmente para su optimización y migración a GPGPUs. También es posible que sea necesario diseñar e implementar nuevos algoritmos (prototipos) a partir de las versiones convencionales para su adaptación a GPGPUs. La meta de este análisis y optimización es la mejora y aceleración de dichos algoritmos en hardware especializado como son las GPGPUs.

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Motivación.
Las enfermedades genéticas y las mutacionales, como el cáncer, están entre las primeras causas de muerte en el mundo occidental. Su diagnóstico y tratamiento, mejoraría enormemente disponiendo de información genómica.

Objetivos.

• Superar los problemas actuales en el procesamiento de la información genómica mediante herramientas software y capacidad de computación.
• Conformar un cloud genómico que ofrezca los servicios de secuenciación, procesamiento, almacenamiento y reporte de resultados de las pruebas realizadas.
• Dotar a los sistemas de información sanitarios de los mecanismos necesarios que soporten la introducción de la medicina personalizada y preventiva en la prestación asistencial, tanto en la prevención, como en la identificación del diagnóstico y del tratamiento más efectivo.

Visión.
El Consorcio presenta una visión global del proyecto en base a tres grandes líneas:

• Base computacional, dónde se ubicarán todos aquellos aspectos relacionados con la arquitectura, con la optimización de la algoritmia y con la secuenciación genómica.
• Asistencial, dónde se analizará la viabilidad económica y los beneficios que supone la genómica para la medicina personalizada. Este será un punto clave a la hora de demostrar a la Administración u otras entidades el gran impacto que puede tener este tipo de servicios médicos.
• Sistema de Información, donde se incluirá todo el análisis y desarrollo necesario para poder ofrecer a los clínicos información útil. Esta línea se realimentará de la primera, siendo una parte fundamental del proyecto.

Ventajas.

• Los resultados de este Proyecto aumentarán el posicionamiento de la Comunidad Valenciana en el Espacio Europeo de Investigación, mejorando sustancialmente su posición investigadora oncológica.
• Se pretende que la Comunidad Valenciana sea pionera en implantar el tratamiento y diagnóstico personalizado de cáncer.
• Los resultados del proyecto permitirán mejorar la eficacia y la sostenibilidad del Sistema de Salud a medio-largo plazo, disminuyendo el gasto asistencial y farmacéutico en pacientes de cáncer. Partiendo de enfermedades familiares, cáncer de mama y ampliando sus horizontes a enfermedades espontáneas, leucemia.

• En el marco del proyecto, la Agència Valenciana de Salut ha proporcionado apoyo institucional y respaldo en cuanto a instalaciones y conocimientos sobre los sistemas de información sanitarios existentes en la Comunitat Valenciana.

• Este proyecto, con nº de expediente IMIDCA/2012/13, ha sido cofinanciado por IMPIVA (Instituto de la Mediana y la Pequeña Industria Valenciana):